◇ボス攻略
◇ボスの攻略法と簡易データベース。データはあくまで目安です。
◇難易度により、ボスの耐久力などが変わります。ノーマルを元に作成。
 １．ディオルム
出現場所チャート２
攻撃可能部目
有効武器 ミサイル
 初ミサイル入手後に出現する長〜い体のボス。
攻撃すべき場所は目。地面に頭を突進させた直後に目を開くので、攻撃をかわしたらすぐに下へ入って上へミサイルを撃ち込もう。また、もたもたしていると逃げられてしまい、再度戦うことになってしまう。
左右の体から出すトゲを壊せば回復補給が可能。
２．ムーワ
出現場所チャート４
攻撃可能部目
有効武器 ミサイル
チャージビーム
ビームも可
 リフトでが通過したとたんに突然襲い掛かってくるモシャモシャ口の虫のようなボス。
サムスに頭から体当たり攻撃をして、当たるとマグマに引きずり込まれてしまう。
簡単な倒し方は、あらかじめ片方にブロックに乗り、リフトを自分側へ移動させておき、ボスが口をモシャモシャ動かしたらリフトに乗って反対側へ。壁に頭を突っ込ませたボスへミサイルを連射する。これを繰り返そう。
途中でマグマを上昇さてきたら一段上のブロックへ回避。補給したい場合は画面最も端っこに行くとボスが口から何かを吐くのでこれを壊せばいい。
３．クレイド
出現場所チャート４
攻撃可能部口の中
有効武器 ミサイル
チャージビーム
 おなじみのボス登場。今回はダメージによって足場が３段階に変化する。ダメージを与えるほど足場が悪くなるので注意。
クレイドは頭にミサイルかチャージビームを撃ち込むと次の瞬間に口を開ける。普通に待っていても開けるが、自分で攻撃のチャンスを作れるので利用してやろう。
補給はゆっくり浮遊する「爪」を壊す。下に落っこちたときは、冷静に「腹のトゲ」を放ってくるタイミングをとらえてダメージを受けないように上に復帰しよう。
４．キル・ギル
出現場所チャート７
攻撃可能部尾
有効武器 ミサイル
チャージビーム
 体当たりや尾針で攻撃してくる巨大な羽虫。弱点も「尾」なので常に下から狙っていく形になる。最大の攻撃のチャンスは敵が左から右へ移動するとき。やや間を空けて追走しながらミサイル連射で大ダメージを与えられる。あらかじめ地面の卵を壊しておくとよい。
体が赤くなり、尾が取れると一度上昇した後、左の壁に激突してスーパーミサイルが入手可能になる。
５．リドリー
出現場所チャート７
攻撃可能部尾以外
有効武器 ミサイル・Ｓミサイル
チャージビーム
 攻撃可能部位が広いのでダメージは与えやすいおなじみのボス。
スーパーミサイルやミサイルを惜しまず撃ちまくれば負けることはないだろう。基本的に下から攻撃することになるが、尾による攻撃に注意。またサムスをつかんでくることもある。ダメージは痛いがリドリーにも大ダメージを与えるチャンスでもある。ダメージが増えると体が赤くなってくる。
６．マザーブレイン
出現場所チャート９
攻撃可能部眼
有効武器 ミサイル・Ｓミサイル
 今回は攻撃可能部が眼だけでやや難易度アップ。しかも目から怪光線を発射し、これがまた威力が高めなのだ。毎度のことながら四方八方から攻撃されて足元はマグマ。スクリューアタックで攻撃を避けつつ、ビーム発射後に開く眼にタイミングよくスーパーミサイルを撃ち込んでやろう。
７．大軍神
出現場所チャート１１
攻撃可能部変な模様に変わったき
有効武器 チャージピストル
 サムスの分身が入った球を持ったボス、大軍神だそう。分身に攻撃すると当然自分もダメージを受けてしまう。攻撃のチャンスはサムスの分身が変な模様に変わった瞬間。コレにチャージピストルで（なければ喰らわせられない）攻撃すれば四方に円を放出しつつ少しパワーアップする。３回当てれば勝ちだ。敵の攻撃といえば体当たりと電撃攻撃か。電撃は地面や壁をはうので注意。サムス自身は１回で５０のダメージを喰う。
８．メカリドリー
出現場所チャート１１
攻撃可能部腹部の赤い部分
有効武器 ミサイル系
 リアルな機械音を響かせながら登場するラスボス、メカリドリー。攻撃力は非常に高いものの、攻撃が単調で回避に苦労しない。腕を振り下ろす攻撃に注意か。３発ミサイルはスクリューアタックで壊せば補給できる。攻撃のチャンスは腕、頭とも腹から離れているとき、この間だけ腹部の赤い部分を攻撃可能なのだ。標的が微妙な高さにあるので、ちょこっとジャンプして攻撃しないと当たらない。耐久力は弱くスーパーミサイル5,6発で倒すことが可能。